幾乎所有胎兒的內髒器官，在出生前都會持續不斷的成長變化，因此並非在早期檢查時，爲正常狀況的器官，就能保證在出生後也一定正常。也因爲超音波受限于媽媽肚皮及子宮的阻擋，無法調整胎兒的姿勢及位置，無法獲得某些角度的影像。所以，會出現因胎兒成長狀況而造成超音波檢查有所限製的情況。
1·水腦
有許多水腦或水腎的狀況，都會到了懷孕後期才逐漸産生。
2·全盲
胎兒在子宮內因爲沒有光線的刺激，因此不會睜開眼睛，所以無法診斷出先天全盲或小眼症的狀況。
3·聽力
在胎兒5～6個月大時，聽力已有發育，但目前沒有任何的方式可以得知，胎兒是否有先天性聽障的問題。
4·先天心髒病
心髒的心房中隔(即卵圓孔)，以及動靜脈導管，都是在出生後才會逐漸關閉，雖然是在出生便可輕易診斷出的心髒病，卻無法在出生前就得知。
5·腸胃道阻塞
腸胃道的阻塞病變，極少數會出現在懷孕24周之前，因爲胎兒在懷孕前期，很少大口的吞進羊水。
6·肢(指、趾)端異常
像是手腳內翻或外翻、多指(趾)、並指或指節缺失等異常狀況，也因爲胎兒常處于握拳狀態，幾乎無法由超音波確切診斷。
7·侏儒症
有部分的侏儒症狀，無法在早期診斷出來。因爲胎兒在6～7個月大的時候，就會逐漸停止骨頭的發育生長。
8·先天性代謝異常
絕大部分的生化代謝異常疾病，例如黏多醣症，都要等到寶寶出生進食後，才會逐漸發病。也因此許多致死性的生化代謝異常，在産前無法辨認，除非媽媽已生過類似疾病的寶寶。
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